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Westfälische Wilhelms-Unibersität Münster Institut für Evolution und Biodiversität
Evolution und Biodiversität der Pflanzen
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      • Ben Stöver

Dr. Ben Stöver

  • Postdoc (AG für Evolution und Biodiversität der Pflanzen)
  • IT Administrator (AG für Evolution und Biodiversität der Pflanzen)

E-Mail: BenStoever@uni-muenster.de
Telefon: +49 251 83-21647
Fax: +49 251 83-24668
Raum: 105

Publikationen

Sortierung:  nach Erscheinungsdatum  nach Typ

  • Aufsatz (Zeitschrift)

    Stöver BC, Wiechers S, Müller KF: JPhyloIO: A Java library for event-based reading and writing of different phylogenetic file formats through a common interface. BMC Bioinformatics 2019, 20 (Details)

    Barré P, Stöver BC, Müller KF, Steinhage V: LeafNet: A computer vision system for automatic plant species identification. Ecological Informatics 2017, 40:50-56 (Details)

    Kilian N, Henning T, Plitzner P, Müller A, Güntsch A, Stöver BC, Müller KF, Berendsohn WG, Borsch T: Sample data processing in an additive and reproducible taxonomic workflow by using character data persistently linked to preserved individual specimens. Database 2015, 2015:bav094 (Details)

    Stöver BC, Müller KF: TreeGraph 2: combining and visualizing evidence from different phylogenetic analyses. BMC Bioinformatics 2010, 11 (Details)

  • Buchbeitrag (Sammel-, Herausgeberband)

    Grimm J, Hoffmann M, Stöver BC, Müller KF, Steinhage V: Image-Based Identification of Plant Species Using a Model-Free Approach and Active Learning. In Friedrich G, Helmert M, Wotawa F: KI 2016: Advances in Artificial Intelligence, 2016, Springer International Publishing; 169-176 (Details)

  • Koferenzbeitrag (Abstract/Poster)

    Stöver BC, Brech P, Wiechers S, Müller KF: Metadata modeling in phylogenetic software to increase data reuse and reproducibility. 1st Münster Evolution Meeting; Münster, Germany; 2018 (Details)

    Plitzner P, Müller A, Güntsch A, Berendsohn WG, Kohlbecker A, Kilian N, Henning T, Stöver BC: The CDM Applied: Unit-Derivation, from Field Observations to DNA Sequences. TDWG 2017 Annual Conference; Ottawa, Canada; 2017 (Details)

    Wiechers S, Müller KF, Stöver BC: Increasing data accessibility and reuse in phylogenetics by employing externally defined ontologies. 6th annual Symposium of the Münster Graduate School of Evolution; Münster, Germany; 2017 (Details)

    Stöver BC, Wiechers S, Müller KF: JPhyloIO - A Java library for event-based reading and writing of different alignment and tree formats through one common interface. European Conference on Computational Biology (ECCB); The Hague, The Netherlands; 2016 (Details)

    Wiechers S, Müller KF, Stöver BC: New comparison and annotation methods of the phylogenetic tree editor TreeGraph 2. 5th annual Münster Graduate School of Evolution Symposium; Münster, Germany; 2015 (Details)

    Stöver BC, Wiechers S, Müller KF: Recent development of the phylogenetic tree editor TreeGraph 2. German Conference on Bioinformatics (GCB); Dortmund, Germany; 2015 (Details)

    Stöver BC, Müller KF: LibrAlign - A powerful Java GUI library for MSA and attached raw and meta data. IPAM Multiple Sequence Alignment Workshop; Los Angeles, USA; 2015 (Details)

    Stöver BC, Müller KF: AlignmentComparator - Comparing and annotating alternative alignments of the same data set. IPAM Multiple Sequence Alignment Workshop; Los Angeles, USA; 2015 (Details)

    Stöver BC, Müller KF: LibrAlign - A Java library with powerful GUI components for multiple sequence alignment and attached raw and meta data. German Conference on Bioinformatics (GCB); Bielefeld, Germany; 2014 (Details)

    Stöver BC, Müller KF: AlignmentComparator - A GUI application to efficiently visualize and annotate differences between alternative multiple sequence alignments. 4th annual Münster Graduate School of Evolution Symposium; Münster, Germany; 2014 (Details)

    Stöver BC, Müller KF: LibrAlign - A GUI library for displaying and editing multiple sequence alignments and attached data. BioDivEvo 2014; Dresden, Germany; 2014 (Details)

    Stöver BC, Müller KF: Software in the BioInfWeb project. 2nd annual Münster Graduate School of Evolution Symposium; Münster, Germany; 2012 (Details)

    Stöver BC, Quandt D, Müller KF: Complex mutations and multiple sequence alignment - Example: Hairpin-initiated repeats (HIRs). 2nd annual Münster Graduate School of Evolution Symposium; Münster, Germany; 2012 (Details)

  • Forschungsbereiche

    • DNA sequence alignment for phylogenetic analysis
    • Indel evolution
    • Phylogenetic signal in highly variable chloroplast DNA markers
    • EDIT Campanula Portal
    • Computer vision
    • Software development
  • Beruflicher Werdegang

    2018 Wissenschaftlicher Mitarbeiter (als Postdoc) in der Arbeitsgruppe für Evolution und Biodiversität der Pflanzen (Prof. Müller, Institut für Evolution und Biodiversität, WWU)
    2011 - 2018 Wissenschaftlicher Mitarbeiter (während der Promotion) in der Arbeitsgruppe für Evolution und Biodiversität der Pflanzen (Prof. Müller, Institut für Evolution und Biodiversität, WWU)
    2010 - 2011 Wissenschaftliche Hilfskraft in der Arbeitsgruppe für Evolution und Biodiversität der Pflanzen (Prof. Müller, Institut für Evolution und Biodiversität, WWU)
    2009 - 2010 Studentische Hilfskraft in der Arbeitsgruppe für Evolution und Biodiversität der Pflanzen (Prof. Müller, Institut für Evolution und Biodiversität, WWU)
    2008 - 2009 Studentische Hilfskraft in der Arbeitsgruppe für Systematik und Evolution (Kai Müller, Nees Institut, Universität Bonn) Aufgaben: Entwicklung verschiedener phylogenetischer Software (siehe z.B. http://treegraph.bioinfweb.info)
    2006 - 2009 Studentische Hilfskraft am Lehrstuhl von Prof. Bleckmann (Abteilung für vergleichende Neurobiologie, Institut für Zoologie, Universität Bonn) Aufgabe: Entwicklung einer dreidimensional arbeitenden Objektverfolgungssoftware im DFG Schwerpunktprogramm 1207 ("Strömungsbeeinflussung in der Natur und Technik")
  • Akademische Ausbildung

    2011 - 2018 Promotion in der Arbeitsgruppe für Evolution und Biodiversität der Pflanzen (Prof. Müller, Institut für Evolution und Biodiversität, WWU)
    2010 Mündliche Diplomprüfung in Physik (Zusatzfach)
    2010 Verleihung des Diploms in Biologie (Note: 1,0, mit Auszeichnung)
    2009 - 2010 Diplomarbeit in der Arbeitsgruppe für Evolution und Biodiversität der Pflanzen von Prof. Müller (Institut für Evolution und Biodiversität, WWU) in Kooperation mit Prof. Quandt (Nees Institut, Universität Bonn), Title: "Entwicklung und Implementierung eines Algorithmus zur Lokalisation von Haarnadel-bedingten Tandem-Wiederholungen"
    2009 Mündliche Diplomprüfungen in Biologie (Fächer: Botanik, Neurobiologie, Informatik)
    2005 Vordiplom in Biologie an der Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn (Fächer: Pflanzenphysiologie, Neurobiologie, Genetik, Zellbiologie, Physik, Chemie)
    1995 - 2002 Besuch des Stiftisches Gymnasium Düren (Abitur), Leistungskurse: Biologie, Physik
  • Arbeiten

    • Entwicklung und Implementierung eines Algorithmus zur Lokalisierung von Haarnadel-bedingten Tandem-Wiederholungen (Diplomarbeit, abgeschlossen am Feb 28, 2010)
    • Software zur Förderung von Datenwiederverwendbarkeit und Reproduzierbarkeit in der Phylogenetik und Phylogenomik (Doktorarbeit, abgeschlossen am Nov 7, 2018)
  • Entwickelte Software

    • bioinfweb.commons.java (http://commons.bioinfweb.info/Java/)
    • JTreeSS (http://bioinfweb.info/JTreeSS/)
    • JPhyloIO (http://bioinfweb.info/JPhyloIO/)
    • TreeGraph 2 (http://treegraph.bioinfweb.info/)
    • PhyDE 2 (http://bioinfweb.info/PhyDE2/)
    • LibrAlign (http://bioinfweb.info/LibrAlign)
    • AlignmentComparator (http://bioinfweb.info/AlignmentComparator)
    • TIC (http://bioinfweb.info/TIC/)
    • LeafNet (http://www.leafnet.pbarre.de/)
    • GraphicMeasurer (http://gm.bioinfweb.info/)
    • HIR Finder
    • EDIT Taxonomic Editor (http://cybertaxonomy.eu/taxeditor/)
  • Weitere Arbeitsgruppen am IEB
    • Molekulare Evolution & Bioinformatik (Prof. Dr. Erich Bornberg-Bauer)
    • Evolutionäre Zellbiologie (Dr. Francesco Catania)
    • Limnologie (Prof. Dr. Elisabeth I. Meyer)
    • Evolution & Sexueller Konflikt (Dr. Claudia Fricke)
    • Molekulare Evolution & Soziobiologie (Prof. Dr. Jürgen Gadau)
    • Evolutionäre Ökologie der Tiere (Prof. Dr. Joachim Kurtz)
    • Plant Adaptation-in-action (Prof. Dr. Shuquing Xu)
  • Weitere Lehre am IEB
    • Research Training group 2220 EvoPAD
    • Münster Graduate School of Evolution
    • Special Study Program (SSP) - Evolution & Biocomplexity
  • Botanischer Garten der WWU
  • bioinfweb Software Portal
  • Münster Graduate School of Evolution
  • Fachbereich Biologie der WWU

Kontakt

AG Evolution und Biodiversität der Pflanzen
Institut für Evolution und Biodiversität

Hüfferstraße 1
48149 Münster

Fax: +49 251-83-24831
Tel. und Email siehe Mitarbeiterliste
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