Aktuelles aus der AG f?r Evolution and Biodiversit?t der Pflanzen, IEB, WWU M?nsterhttp://www2.ieb.uni-muenster.de/EvolBiodivPlants/de/AktuellesNeuigkeiten aus der AG f?r Evolution and Biodiversit?t der Pflanzen am Institut for Evolution and Biodiversit?t der WWU M?nster.jRSSGenerator by Henrique A. Viecilihttp://blogs.law.harvard.edu/tech/rssFreie Plätze im Lehramt-Fortgeschrittenenmodul "Botanik im Alltag" (Schwerpunkt ÖEB)Im Modul (09.09.2019 bis 13.09.2019) sind noch mehrere Pl&auml;tze frei. Am Modul k&ouml;nnen Studierenden folgender Studieng&auml;nge teilnehmen:<ul> <li>Bachelor HRSGe Biologie</li> <li>MEd GymGes/BK Biologie</li> <li>MEd HRSGe Biologie</li> </ul>Bitte wenden Sie sich bei Interesse an Frau Dr. Mirja Hentschel (mirja.hentschel@uni-muenster.de).Di, 20 Aug 2019 00:00:00 MESZPaper zu JPhyloIO veröffentlichthttp://doi.org/10.1186/s12859-019-2982-3Unsere <a href="http://bioinfweb.info/JPhyloIO/" class="ext">Bibliothek</a> zum Lesen und Schreiben phylogenetischer Dateiformate &uuml;ber eine einheitliche Ereignis-basierte Schnittstelle wurde in BMC Bioinformatics ver&ouml;ffentlicht. <br /><br />St&ouml;ver BC, Wiechers S, M&uuml;ller KF: JPhyloIO: <a href="http://doi.org/10.1186/s12859-019-2982-3" class="ext">A Java library for event-based reading and writing of different phylogenetic file formats through a common interface</a>. <i>BMC Bioinformatics</i> 2019, <b>20</b>:401Mo, 22 Jul 2019 00:00:00 MESZVersion 1.0.0 von <i>JPhyloIO</i> veröffentlichthttp://bioinfweb.info/JPhyloIO/Eine <a href="http://bioinfweb.info/JPhyloIO/Download" class="ext">neue Version</a> unserer Bibliothek zum Lesen und Schreiben phylogenetischer Dateiformate &uuml;ber eine einheitliche Ereignis-basierte Schnittstelle wurde ver&ouml;ffentlicht.Mi, 12 Jun 2019 00:00:00 MESZVersion 2.15.0 von TreeGraph veröffentlichthttp://treegraph.bioinfweb.info/Eine neue Version unseres Editors f&uuml;r phylogenetische B&auml;ume - TreeGraph 2 - kann unter <a href="http://treegraph.bioinfweb.info/Download" class="ext">http://treegraph.bioinfweb.info/Download</a> heruntergeladen werden.Fr, 26 Apr 2019 00:00:00 MESZVersion 3.3.1 von <i>bioinfweb.commons.java</i> veröffentlichthttp://commons.bioinfweb.info/Java/Eine neue Version unserer Java Bibliothek <i>bioinfweb.commons</i> wurde <a href="http://commons.bioinfweb.info/Java/Download" class="ext">ver&ouml;ffentlicht</a>. Sie besteht aus Modulen mit vielf&auml;ltigen Anwendungsbereichen die unter <a href="http://commons.bioinfweb.info/Java/License/LGPL" class="ext">GNU LGPL 3</a> &ouml;ffentlich zur Verf&uuml;gung gestellt werden.Fr, 26 Apr 2019 00:00:00 MESZNeue Version von <i>PhyDE 2</i> verfügbarhttp://bioinfweb.info/PhyDE2Eine <a href="http://bioinfweb.info/PhyDE2/Download" class="ext">neue Version</a> von <i>PhyDE 2</i> wurde ver&ouml;ffentlicht. Es k&ouml;nnen nur mehrere Alignments gleichzeitig bearbeitet werden.Do, 29 Nov 2018 00:00:00 MEZVersion 1.1.0 von <i>AlignmentComparator</i> veröffentlichthttp://bioinfweb.info/AlignmentComparator/Eine <a href="http://bioinfweb.info/AlignmentComparator/Download" class="ext">neue Version</a> unserer Anwendung zum visuellen Vergleichen alternativer Multisequenzalignierungen eines Datensatzes ist verf&uuml;gbar.Mi, 18 Apr 2018 00:00:00 MESZVersion 0.9.0 von <i>LibrAlign</i> veröffentlichthttp://bioinfweb.info/LibrAlign/Eine <a href="http://bioinfweb.info/LibrAlign/Download" class="ext">neue Version</a> unserer GUI-Bibliothek mit m&auml;chtigen Komponenten zum Anzeigen und Bearbeiten von Multisequenzalignments und verkn&uuml;pften Roh- und Metadaten wurde ver&ouml;ffentlicht.Mi, 18 Apr 2018 00:00:00 MESZPoster zur GBOL 5 Webapp auf dem 7. MGSE Symposium vorgestellthttp://www2.ieb.uni-muenster.de/EvolBiodivPlants/en/Publications/ConferenceContribution?id=137544Ein <a href="http://www2.ieb.uni-muenster.de/EvolBiodivPlants/en/Publications/ConferenceContribution?id=137544" class="int">Poster</a> &uuml;ber die <a href="http://gbol5.de/" class="ext">GBOL 5</a> Webapp wird auf dem <a href="https://www.uni-muenster.de/Evolution/mgse/symposium/symposium2018.html" class="int">j&auml;hrlichen Symposium der M&uuml;nster Graduate School of Evolution (MGSE)</a> vorgestellt.Mi, 21 Mär 2018 00:00:00 MEZbioinfweb Repositories auf GitHubhttps://github.com/bioinfwebDie Quelltexte von insgesamt sechs <i>bioinfweb</i> Softwareprojekten sind nun auf <i>GitHub</i> verf&uuml;gbar. Die Repositories von <a href="https://github.com/bioinfweb/TreeGraph2" class="ext">TreeGraph 2</a>, <a href="https://github.com/bioinfweb/JPhyloIO" class="ext">JPhyloIO</a>, <a href="https://github.com/bioinfweb/LibrAlign" class="ext">LibrAlign</a>, <a href="https://github.com/bioinfweb/commons.java" class="ext">bioinfweb.commons.java</a>, <a href="https://github.com/bioinfweb/AlignmentComparator" class="ext">AlignmentComparator</a> und <a href="https://github.com/bioinfweb/TIC" class="ext">TIC</a> sind nun mit <i>GitHub</i> synchronisiert.<br /><br />Beitr&auml;ge und pull requests sind willkommen.Mi, 30 Aug 2017 00:00:00 MESZbioinfweb Projekte auf ResearchGateSeit heute gibt es ResearchGate Projektseiten f&uuml;r unsere bioinformatische Software. Dort gibt es Informationen &uuml;ber neue Versionen, Funktionen und Ver&ouml;ffentlichungen. Auf jeder Projektseite gibt es au&szlig;erdem die M&ouml;glichkeiten Fragen zur Software oder deren Verwendung zu stellen.<br /><br />Die folgenden Projektseiten sind nun verf&uuml;gbar:<ul> <li><a href="http://r.bioinfweb.info/RGTreeGraph2" class="ext">TreeGraph 2</a></li> <li><a href="http://r.bioinfweb.info/RGJPhyloIO" class="ext">JPhyloIO</a></li> <li><a href="http://r.bioinfweb.info/RGLibrAlign" class="ext">LibrAlign</a></li> <li><a href="http://r.bioinfweb.info/RGAlignmentComparator" class="ext">AlignmentComparator</a></li> </ul>Mo, 21 Aug 2017 00:00:00 MESZVersion 2.14.0 von TreeGraph veröffentlichthttp://treegraph.bioinfweb.info/Eine neue Version unseres Editors f&uuml;r phylogenetische B&auml;ume - TreeGraph 2 - kann unter <a href="http://treegraph.bioinfweb.info/Download" class="ext">http://treegraph.bioinfweb.info/Download</a> heruntergeladen werden.Mo, 26 Jun 2017 00:00:00 MESZNeuer Artikel veröffentlichtUnser Artikel Barr&eacute; P, St&ouml;ver BC, M&uuml;ller KF, Steinhage V: <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.ecoinf.2017.05.005" class="ext">LeafNet: A computer vision system for automatic plant species identification</a> wurde in Ecological Informatics ver&ouml;ffentlicht.Mo, 22 Mai 2017 00:00:00 MESZPoster zur Behandlung von Metadaten in JPhyloIO, LibrAlign und TreeGraph 2 auf dem 6. MGSE Symposium vorgestellthttp://www2.ieb.uni-muenster.de/EvolBiodivPlants/en/Publications/ConferenceContribution?id=126838Ein <a href="http://www2.ieb.uni-muenster.de/EvolBiodivPlants/en/Publications/ConferenceContribution?id=126838" class="int">Poster</a> &uuml;ber die Nutzung extern definierter Ontologien zur Verarbeitung von Metadaten in <a href="http://bioinfweb.info/JPhyloIO/" class="ext">JPhyloIO</a>, <a href="http://bioinfweb.info/LibrAlign/" class="ext">LibrAlign</a> und <a href="http://treegraph.bioinfweb.info/" class="ext">TreeGraph 2</a> wird auf dem <a href="http://www.uni-muenster.de/Evolution/mgse/symposium/symposium2017.html" class="int">6. j&auml;hrlichen Symposium der M&uuml;nster Graduate School of Evolution (MGSE)</a> vorgestellt.Fr, 24 Mär 2017 00:00:00 MEZZu vergebende Abschlussarbeiten in 2017In diesem Jahr sind eine Reihe von Bachelor- und Masterarbeiten aus dem bioinformatischen Zweig unserer Abteilung zu vergeben. Diese k&ouml;nnen u.a. in folgenden Themenbereichen statt finden:<ul> <li>Bionformatische Softwareentwicklung</li> <li>Analyse molekularer Evolution</li> <li>Arterkennung durch maschinelles Sehen</li> </ul>Weitere Informationen zu einzelnen Themen unter <a href="http://go.wwu.de/dc95c" class="int">http://go.wwu.de/dc95c</a>. Bei Interesse oder weiteren Fragen kontaktieren Sie gerne <a href="http://www2.ieb.uni-muenster.de/EvolBiodivPlants/de/Mitarbeiter/Stoever" class="int">Ben St&ouml;ver</a>.Mi, 8 Feb 2017 00:00:00 MEZVersion 2.12.0 von TreeGraph veröffentlichthttp://treegraph.bioinfweb.info/Eine neue Version unseres Editors f&uuml;r phylogenetische B&auml;ume - TreeGraph 2 - kann unter <a href="http://treegraph.bioinfweb.info/Download" class="ext">http://treegraph.bioinfweb.info/Download</a> heruntergeladen werden.Mo, 9 Jan 2017 00:00:00 MEZDemoanwendungen für <i>JPhyloIO</i> verfügbarAls Teil der Dokumentation unserer <i>Java</i> Bibliothek <i>JPhyloIO</i> zum Ereignis-basierten Lesen und Schreiben phylogenetischer Daten, stehen nun vier <a href="http://r.bioinfweb.info/JPIODemo" class="ext">Demoanwendungen</a> zur Verf&uuml;gung. Sie erm&ouml;glichen den einfachen Einstieg und erkl&auml;ren die M&ouml;glichkeiten.Fr, 2 Dez 2016 00:00:00 MEZNeuer Artikel veröffentlichtUnser folgender neuer Artikel wurde ver&ouml;ffentlicht:<br /><br />Grimm J, Hoffmann M, <b>St&ouml;ver BC</b>, <b>M&uuml;ller KF</b>, Steinhage V: <a href="http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-46073-4_16" class="ext">Image-Based Identification of Plant Species Using a Model-Free Approach and Active Learning</a>. In Friedrich G, Helmert M, Wotawa F: KI 2016: Advances in Artificial Intelligence, 2016, Springer International Publishing; 169-176Do, 8 Sep 2016 00:00:00 MESZNachruf Joachim RöschenbleckWir nehmen Abschied von unserem pl&ouml;tzlich und viel zu fr&uuml;h verstorbenen Kollegen, Dozenten, Mitarbeiter und Freund <b>Dr. Joachim R&ouml;schenbleck</b>.<br /><br />Mit au&szlig;ergew&ouml;hnlichem Engagement und enormer Kompetenz war Joachim R&ouml;schenbleck viele Jahre als Wissenschaftlicher Mitarbeiter im Botanischen Garten der Universit&auml;t M&uuml;nster und in den Instituten f&uuml;r Evolution und Biodiversit&auml;t und Biologie und Biotechnologie der Pflanzen t&auml;tig.<br /><br />Durch beharrlichen Einsatz und gro&szlig;e Leidenschaft f&uuml;r seine T&auml;tigkeit konnte er nicht nur wesentliche Erkenntnisse zu seinem Forschungsfeld beitragen, sondern auch viele Impulse zur stetigen Weiterentwicklung des Botanischen Gartens geben.<br /><br />Den Besuchern des Botanischen Gartens war Joachim nicht zuletzt durch seine unz&auml;hligen und exzellenten F&uuml;hrungen bekannt. Besonders beeindruckten hierbei seine au&szlig;ergew&ouml;hnlichen Pflanzenkenntnisse, wie sie in diesem Umfang inzwischen &auml;u&szlig;erst selten geworden sind. Dabei vermochte er sein Wissen immer auf sehr unterhaltsame und eindr&uuml;ckliche Weise zu vermitteln. So konnte er auch die Studierenden auf F&uuml;hrungen, Exkursionen und in Praktika f&uuml;r botanische Inhalte und Fragestellungen begeistern und hinterl&auml;sst als gesch&auml;tzter Dozent auch in der universit&auml;ren Lehre eine gro&szlig;e L&uuml;cke.<br /><br />Seine immer lebensfrohe, hilfsbereite und kollegiale Art wird uns allen sehr fehlen. Unser aufrichtiges Mitgef&uuml;hl gilt den Angeh&ouml;rigen. Tief betroffen trauern wir mit ihnen um Joachim.<br /><br /><i>F&uuml;r den Fachbereich Biologie: Prof. Dr. Wolf-Michael Weber, Dekan</i><br /><br /><i>F&uuml;r alle Studierenden des Fachbereichs: Die Fachschaft der Biologie</i><br /><br /><i>F&uuml;r alle Mitarbeiter des Instituts f&uuml;r Evolution und Biodiversit&auml;t: Prof. Dr. Kai M&uuml;ller, Gesch&auml;ftsf&uuml;hrender Direktor</i><br /><br /><i>F&uuml;r alle Mitarbeiter des Instituts f&uuml;r Biologie und Biotechnologie der Pflanzen: Prof. Dr. Michael Hippler, Gesch&auml;ftsf&uuml;hrender Direktor</i><br /><br />Informationen zur Trauerfeier am 18.06.2016 finden Sie in der <a href="http://www.trauer.ms/Traueranzeige/Joachim-Roeschenbleck-2016-06-08-Muenster-Mitte-16264569" class="ext">Traueranzeige</a>.Mi, 8 Jun 2016 00:00:00 MESZNeuer Artikel veröffentlichtUnser folgender neuer Artikel wurde ver&ouml;ffentlicht:<br /><br />Kilian N, Henning T, Plitzner P, M&uuml;ller A, G&uuml;ntsch A, <b>St&ouml;ver BC</b>, <b>M&uuml;ller KF</b>, Berendsohn WG, Borsch T: <a href="http://dx.doi.org/10.1093/database/bav094" class="ext">Sample data processing in an additive and reproducible taxonomic workflow by using character data persistently linked to preserved individual specimens</a>. <i>Database</i>, <b>2015</b>:bav094<br /><br />In unserer Gruppe wurden die Komponenten zur Verarbeitung molekularer Daten entwickelt, einschlie&szlig;lich der Bilbliotheken <a href="http://bioinfweb.info/LibrAlign" class="ext">LibrAlign</a>, <a href="http://bioinfweb.info/JPhyloIO" class="ext">JPhyloIO</a> und <a href="http://bioinfweb.info/TIC" class="ext">TIC</a>.Do, 1 Okt 2015 00:00:00 MESZVersion 2.5.0 von TreeGraph 2 veröffentlicht und auf GCB vorgestellthttp://www2.ieb.uni-muenster.de/EvolBiodivPlants/en/Publications/ConferenceContribution?id=106662Eine neue Version (2.5.0) unseres Editors f&uuml;r phylogenetische B&auml;ume wurde ver&ouml;ffentlicht. Au&szlig;erdem wurden neue Funktionen von TreeGraph 2 in einem <a href="http://www2.ieb.uni-muenster.de/EvolBiodivPlants/en/Publications/ConferenceContribution?id=106662" class="int">Poster</a> auf der <a href="http://gcb2015.cs.tu-dortmund.de/" class="ext">German Conference on Bioinformatics 2015</a> vorgestellt.So, 27 Sep 2015 00:00:00 MESZVersion 1.1.0 von <i>bioinfweb.commons.java</i> veröffentlichthttp://commons.bioinfweb.info/Java/Eine neue Version unserer Java Bibliothek <i>bioinfweb.commons</i> wurde <a href="http://commons.bioinfweb.info/Java/Download" class="ext">ver&ouml;ffentlicht</a>. Sie besteht aus Modulen mit vielf&auml;ltigen Anwendungsbereichen die unter <a href="http://commons.bioinfweb.info/Java/License" class="ext">GNU GPL 4</a> &ouml;ffentlich zur Verf&uuml;gung gestellt werden.Mi, 11 Feb 2015 00:00:00 MEZVersion 0.3.0 von LibrAlign veröffentlichthttp://bioinfweb.info/LibrAlign/Eine neue Version unserer Java Alignment GUI Bilbliothek <a href="http://bioinfweb.info/LibrAlign/" class="ext">LibrAlign</a> w&uuml;rde ver&ouml;ffentlicht und auf dem <a href="http://www.ipam.ucla.edu/programs/workshops/multiple-sequence-alignment/" class="ext">Multiple Sequence Alignment Workshop</a> am IPAM der UCLA in Los Angeles <a href="http://www2.ieb.uni-muenster.de/EvolBiodivPlants/en/Publications/ConferenceContribution?id=100872" class="int">vorgestellt</a>.Mo, 12 Jan 2015 00:00:00 MEZAlignmentComparator auf MSA Workshop (IPAM, UCLA) vorgestellthttp://bioinfweb.info/AlignmentComparator/Unsere Software <a href="http://bioinfweb.info/AlignmentComparator/" class="ext">AlignmentComparator</a> zum Vergleich alternativer Multisequenzalignments des selben Datensatzes wurde auf dem <a href="http://www.ipam.ucla.edu/programs/workshops/multiple-sequence-alignment/" class="ext">Multiple Sequence Alignment Workshop</a> am IPAM der UCLA in Los Angeles <a href="http://www2.ieb.uni-muenster.de/EvolBiodivPlants/en/Publications/ConferenceContribution?id=100873" class="int">vorgestellt</a>.Mo, 12 Jan 2015 00:00:00 MEZ